У отрядов есть три возможных типа ИИ: базовый, скоординированный и подчинённый. Почти все отряды в игре скоординированы, кроме отрядов мутантов в начале игры, отрядов мутантов на карантине и пары других случаев. Скоординированные отряды сначала выбирают цели, которые будут атаковать (если возможно) из числа тех, кто будет баффать или лечить при первой возможности. Под такие условия в основной кампании подходит три группы юнитов: мокрицы, медики и проповедники.